Мы занимаемся разработкой биоинформатических инструментов и анализом омиксных данных
Разработка ПО и ИИ-решений для анализа данных NGS секвенирования и протеомного анализа
Проведение масштабных вычислений по запросу заказчика, на серверах Центра ИИ СПбГУ
Использование методов Машинного обучения и Искусственного интеллекта для анализа омиксных данных
Реализация современных высокопроизводительных алгоритмов в виде ПО профессионального
качества для повышения точности и скорости анализа данных NGS
качества для повышения точности и скорости анализа данных NGS
Разработка пайплайнов и ПО «под ключ» с учетом специальных задач заказчиков
Как мы работаем
2
3
Отчетность
1
Подготовка отчетов с результатами анализа, включая графики и таблицы для представления данных
Анализ данных секвенирования
нового поколения NGS
нового поколения NGS
Предобработка данных:
- Оценка качества данных
- Фильтрация
- Удаление артефактов
Выравнивание прочтений на референсный геном
Генотипирование и анализ вариаций - выявление однонуклеотидных полиморфизмов (SNPs), инделов и структурных вариаций
Аннотация выявленных вариантов:
с использованием баз данных
Сборка геномов de novo
Анализ данных RNA-seq (дифференциальная экспрессия, альтернативный сплайсинг)
Поиск ассоциаций с помощью GWAS
Общие и специализированные решения для анализа опухолевых геномов:
- Выявление драйверных мутаций
- Анализ мутационных подписей и клональной изменчивости опухолей
- Построение прогностических моделей развития опухолей и ответа на лечение
- Оценка качества данных
- Фильтрация
- Удаление артефактов
Выравнивание прочтений на референсный геном
Генотипирование и анализ вариаций - выявление однонуклеотидных полиморфизмов (SNPs), инделов и структурных вариаций
Аннотация выявленных вариантов:
с использованием баз данных
Сборка геномов de novo
Анализ данных RNA-seq (дифференциальная экспрессия, альтернативный сплайсинг)
Поиск ассоциаций с помощью GWAS
Общие и специализированные решения для анализа опухолевых геномов:
- Выявление драйверных мутаций
- Анализ мутационных подписей и клональной изменчивости опухолей
- Построение прогностических моделей развития опухолей и ответа на лечение
Выполняем стандартный биоинформатический анализ с использованием классических
инструментов и стандартизированных пайплайнов
инструментов и стандартизированных пайплайнов
Осуществляем консультирование по всем направлениям анализа омиксных данных
Занимаемся планированием экспериментов и обработку результатов по запросам заказчика
Чем ещё мы можем помочь?
Интерпретация результатов
Статистический анализ и визуализация данных
Использование биоинформатических подходов для выявления паттернов и биологических значений
Использование методов ML и искусственного интеллекта для анализа данных
Использование биоинформатических подходов для выявления паттернов и биологических значений
Использование методов ML и искусственного интеллекта для анализа данных
info@mateomica.ru
Основное направление деятельности — геномная нестабильность опухолей, динамические мутации в геноме
Генеральный директор МИП «Центр искусственного интеллекта СПбГУ»
Специалист по коммерциализации биотехнологий. Сфера научных интересов — диагностика вирусных инфекций при иммуносупрессии.
Основное направление деятельности — геномика, включая анализ опухолевых геномов
Опыт коммерческой разработки ПО более 20 лет, включая работу как в стартапах, так и в крупных международных компаниях
Мы – команда, состоящая из профессиональных генетиков, молекулярных биологов, биоинформатиков, математиков
и программистов
и программистов
Анна
Аксенова
Аксенова
Михаил
Ланговой
Ланговой
Виталий
Бурылев
Бурылев
Анна
Жук
Жук
Владимир
Широков
Широков
Кандидат биологических наук, генетик, молекулярный биолог
Dr. rer. nat., специалист по искусственному интеллекту
Кандидат биологических наук
Кандидат биологических наук, биоинформатик, генетик
CTO, главный программист
Кроме того у нас есть:
Команда опытных программистов
Специалисты
Центра Искусственного интеллекта СПбГУ
Центра Искусственного интеллекта СПбГУ
Ведущие ученые в области генетики и молекулярной биологии